タイレルと会っていたはずのエリオットが目を覚ますと、世界は一変していた。f・ソサエティが計画した革命は見事に成功したのだ。しかし違和感をぬぐえないエリオットは、再びミスター・ロボットを呼び起こす。
ミスター・ロボットが父親であると思い出したエリオット。彼は父と共に、故郷への旅を始める。一方、E・コープ相手の訴訟を起こしたアンジェラは、コルビーの訪問を受け、驚くべき提案を受ける。
作戦再開に向け動き出したエリオット。5ヵ所に増えたスティール・マウンテンに狙いを定める彼の前に、ダーク・アーミーのボス、ホワイトローズが立ちはだかる。一方、タイレルはシャロン殺害を疑われ窮地に陥る。
アンジェラは有毒廃棄物問題についてコルビーと一対一の面談に挑むことに。E・コープではスコット最高技術責任者就任が正式に決定。焦ったタイレルはスコットの妻シャロンを再度誘惑しようとするが…
ベラがシェイラを人質に取り、ハッキングで自分を脱獄させるようエリオットを脅迫。また、アンジェラは母の死因となった有毒廃棄物問題の訴訟をやり直そうと動き始める。
匿名通報により刑務所にいるベラは、密告者がエリオットであると突き止める。一方、エリオットは難攻不落のスティール・マウンテンへの侵入を開始。そんな中、タイレルは最高技術責任者の候補であるスコットと接触する。
f・ソサエティのメンバーたちは、E・コープのデータ保管地スティール・マウンテンのデータを破壊すべく現地へ出発。道中でモルヒネの禁断症状を起こしたエリオットは夢とも現実ともつかない幻覚を見る。
新候補の登場で最高技術責任者への就任に暗雲が立ち込めてきたタイレル。焦る彼は情報収集に動く。一方、ミスター・ロボットにケガを負わされたエリオットはf・ソサエティを抜け普通の生活を送ると誓うが…
タイレルの申し出を断ったエリオット。追い詰められた彼は、薬物の摂取量が増えていく。そんな折、シェイラの売人ベラの行動がエリオットを怒らせる。そして、遂にミスター・ロボットから計画の全貌が明かされる。
エリオットは勤務先のオールセーフでハッキング被害に対処したことをきっかけに謎の男“ミスター・ロボット”と出会い、世界最大のコングロマリットを倒すという壮大な革命計画に巻き込まれていく。
